在发酵的时候先用水将菌液稀释，加入秸秆进行搅拌，之后密封后发酵即可。在发酵期间要加适量的玉米粉，保持一定的湿度等待发酵。也可将秸秆粉碎并用水浇湿，还要加些磷酸二铵和腐熟剂，再加些麸皮或玉米面密封发酵，就可作为有机肥使用。使用后能杀死虫卵，还能避免病菌滋生。
一、发酵方法
准备好发酵使用的菌液，并且按照1:100的比例用水稀释，再加入一些秸秆搅拌均匀。然后将其密封好进行发酵就行了。在发酵期间，可以加一些玉米粉。湿度最好是保持在40-60%左右，也就是用手紧握没有水滴落。通常，夏天发酵1-3天就好了，春天和秋季可能需要3-5天，冬天则要一周时间。
二、发酵有机肥方法
把秸秆粉碎后用水
