延续前一集的剧情，狮子亚历克斯(本・斯蒂勒 Ben Stiller 配音)、斑马马蒂(克里斯・洛克 Chris Rock 配音)、长颈鹿迈尔曼(大卫・休默 David Schwimmer 配音)、河马格洛里亚(贾达・萍克・史密斯 Jada Pinkett Smith 配音)以及企鹅们，为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约，对一架破旧的失事飞机进行维修改造，并成功起飞。当大家已经开始庆祝终于可以回到纽约时，飞机却意外降落，迫降到了非洲大草原上。在这儿，狮子亚历克斯终于见到了它的父母。但是由于生活*性上太多不一样，而且言行举止各异，使得这群纽约来的动物们显得格格不入。这群昔日纽约中央公园的动物明星们，在这野外艰难的环境中应该怎么办?虽然在这儿遇见了自己的同类，但因为*性不同，使得自己无法完全融入他们的群体。为了能融入环境，与同类们建立良好的关系，大家都是施展各种招式，笑料百出。
在一颗名为51号星球的行星上，居住着一群通体绿色的高智慧生物，他们的文明高度发达，生活安宁幸福。不过他们也有自己的恐慌，那就是远在几百光年之外的地球人，他们生怕会遭到地球人的入侵和杀害。雷(Justin Long 音)是一个热衷星球研究的青年，他和地球上的小青年没什么两样，做实*报告、跟朋友聊天、追女朋友、找工作。这一日，一艘来自地球的宇航飞船降临51号星球，且刚好落在雷的院子里。宇航员查理・T・巴克(“巨石”强森 Dwayne Johnson 音)在当地引起一系列恐慌，自己也受到不小的惊吓。
在一颗名为51号星球的行星上，居住着一群通体绿色的高智慧生物，他们的文明高度发达，生活安宁幸福。不过他们也有自己的恐慌，那就是远在几百光年之外的地球人，他们生怕会遭到地球人的入侵和杀害。雷(Justin Long 音)是一个热衷星球研究的青年，他和地球上的小青年没什么两样，做实*报告、跟朋友聊天、追女朋友、找工作。这一日，一艘来自地球的宇航飞船降临51号星球，且刚好落在雷的院子里。宇航员查理・T・巴克(“巨石”强森 Dwayne Johnson 音)在当地引起一系列恐慌，自己也受到不小的惊吓。
